Транскриптомика и происхождение облигатного партеногенеза

Наследственность (2023)Цитировать эту статью

3 Альтметрика

Подробности о метриках

Несмотря на наличие облигатно партеногенетических (OP) линий, происходящих от половых предков в различных филогенетических группах, генетические механизмы, дающие начало линиям OP, остаются плохо изученными. Пресноводные микроракообразные Daphnia pulex обычно размножаются посредством циклического партеногенеза. Однако некоторые популяции OP D. pulex возникли в результате наследственной гибридизации и интрогрессии между двумя циклически партеногенетическими (CP) видами D. pulex и D. pulicaria. Эти гибриды OP производят как суббитальные, так и покоящиеся яйца партеногенетически, в отличие от изолятов CP, где покоящиеся яйца производятся посредством обычного мейоза и спаривания. В этом исследовании изучаются полногеномная экспрессия и альтернативные паттерны сплайсинга раннего суббитального производства яиц по сравнению с ранним покоем у изолятов OP D. pulex, чтобы получить представление о генах и механизмах, лежащих в основе этого перехода к облигатному партеногенезу. Наши анализы дифференциальной экспрессии и функционального обогащения выявили подавление генов мейоза и клеточного цикла во время раннего производства яиц в состоянии покоя, а также расходящиеся паттерны экспрессии метаболизма, биосинтеза и сигнальных путей между двумя репродуктивными способами. Эти результаты предоставляют важные гены-кандидаты для будущей экспериментальной проверки, включая ген CDC20, который активирует комплекс, способствующий анафазе в мейозе.

Это предварительный просмотр контента подписки, доступ через ваше учреждение.

Подпишитесь на этот журнал

Получите 12 печатных выпусков и онлайн-доступ.

259,00 долларов США в год

всего $21,58 за выпуск

Возьмите напрокат или купите эту статью

Получите только эту статью до тех пор, пока она вам нужна

$39,95

Цены могут зависеть от местных налогов, которые рассчитываются во время оформления заказа.

Необработанные данные для этого исследования хранятся в NCBI SRA PRJNA847604.

Avise J (2008)Клональность: генетика, экология и эволюция полового воздержания у позвоночных животных. Издательство Оксфордского университета, США

Забронировать Google Академию

Avise JC (2015)Эволюционные взгляды на клональное размножение у позвоночных животных. Proc Natl Acad Sci USA 112(29):8867–8873

Статья CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Эндрюс С. (2010) FastQC: инструмент контроля качества данных последовательностей с высокой пропускной способностью [онлайн]. Доступно онлайн: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/.

Алекса А., Раненфюрер Дж. (2021) topGO: Анализ обогащения онтологии генов. Пакет R версии 2.46.0.

Белл Дж. (1982) Шедевр природы: эволюция и генетика сексуальности. Калифорнийский университет Press, Беркли, Калифорния

Google Scholar

Бленджини К.С., Ибрагимиан П., Васьковикова М., Друтович Д., Солк П., Шиндлер К. (2021)Киназа Авроры А необходима для мейоза в ооцитах мышей. ПЛОС Женет 17:e1009327

Статья CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Буопатия GTK, Hong W (2019)Роль передачи сигналов Hippo Pathway-YAP/TAZ в ангиогенезе. Границы клеточной биологии и биологии развития, 7.

Брандлова Дж., Брандл З., Фернандо CH (1972) Cladocera Онтарио с замечаниями о некоторых видах и распространении. Кан Дж. Зул 50 (11): 1373–1403.

Статья в Академии Google

Карбальо ГБ, Онорато JR, де Лопес GPF, де Сампайо и Шпор TCL (2018) Яркий момент на пути звукового ежа. Общий сигнал ячейки 16(1):11

Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

Колборн Дж.К., Хеберт ПДН (1996)Систематика североамериканских дафний (Crustacea: Anomopoda): молекулярный филогенетический подход. Philos Trans R Soc Lond Ser B: Biol Sci 351 (1337): 349–360